More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2252 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
493 aa  994    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  57.4 
 
 
499 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  48.25 
 
 
489 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  52.67 
 
 
528 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  42.39 
 
 
500 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  54.41 
 
 
472 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  48.06 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  48.95 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  49.79 
 
 
480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  42.86 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  49.59 
 
 
516 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  49 
 
 
523 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  48.84 
 
 
485 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  42.74 
 
 
493 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  42.77 
 
 
498 aa  428  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  46.71 
 
 
474 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  41.15 
 
 
497 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  46.5 
 
 
476 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  50.21 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  48.67 
 
 
490 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  45.95 
 
 
488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  41.88 
 
 
473 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  45.74 
 
 
477 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  48.86 
 
 
502 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  45.07 
 
 
499 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  47.47 
 
 
470 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  50.55 
 
 
506 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  42.71 
 
 
496 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  48.72 
 
 
468 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  43.03 
 
 
496 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  47.62 
 
 
481 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  47.62 
 
 
481 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  47.62 
 
 
481 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  44.07 
 
 
479 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  42.55 
 
 
489 aa  353  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  43.31 
 
 
464 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  41.8 
 
 
490 aa  347  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  41.43 
 
 
490 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  43.84 
 
 
499 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  37.2 
 
 
485 aa  343  5.999999999999999e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  40.93 
 
 
489 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  40.93 
 
 
489 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  40.93 
 
 
489 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  41.14 
 
 
489 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  40.72 
 
 
489 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  44.47 
 
 
518 aa  339  8e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  40.83 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  40.83 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  40.83 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  40.83 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  41.04 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  40.83 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  40.62 
 
 
489 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  40.62 
 
 
489 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  41.06 
 
 
485 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  44.4 
 
 
473 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  40.85 
 
 
520 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  34.58 
 
 
485 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  39.55 
 
 
467 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  40.62 
 
 
472 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.69 
 
 
470 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  33.69 
 
 
482 aa  229  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  41.99 
 
 
471 aa  223  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  43.94 
 
 
579 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.86 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.74 
 
 
482 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.74 
 
 
482 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  27.47 
 
 
472 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  27.47 
 
 
472 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.74 
 
 
472 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  22.99 
 
 
485 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  27.49 
 
 
482 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.47 
 
 
472 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.47 
 
 
472 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.23 
 
 
472 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.23 
 
 
472 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.23 
 
 
472 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.23 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.42 
 
 
505 aa  94.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.11 
 
 
499 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  21.39 
 
 
492 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.39 
 
 
492 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  26.32 
 
 
498 aa  84  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  25.19 
 
 
494 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.01 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  23.69 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  25 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1940  glycerol kinase  25.77 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1188  glycerol kinase  24.45 
 
 
500 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  23.2 
 
 
508 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  22.22 
 
 
505 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  24.04 
 
 
501 aa  77  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.57 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  19.58 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  23.85 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  23.96 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  22.98 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1215  glycerol kinase  23.8 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  22.93 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>