More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0420 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  100 
 
 		 496 aa  1025    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  93.35 
 
 		 496 aa  968    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  69.15 
 
 		 490 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  69.77 
 
 		 490 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  62.24 
 
 		 520 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  62.34 
 
 		 485 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  61.94 
 
 		 472 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  58.56 
 
 		 489 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  58.35 
 
 		 489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  59.08 
 
 		 489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  58.56 
 
 		 489 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  58.35 
 
 		 489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  58.14 
 
 		 489 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  59.11 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  59.11 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  58.14 
 
 		 489 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  59.32 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  59.32 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  58.9 
 
 		 489 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  57.73 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  58.47 
 
 		 489 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  58.36 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  41.43 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  46.09 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  45.47 
 
 		 516 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  46.11 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  39.23 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  42.71 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  41.78 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  44.84 
 
 		 485 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  38.49 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  45.59 
 
 		 472 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  44.59 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  40.04 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  37.12 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  37.94 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  38.04 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  46.25 
 
 		 488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  38.74 
 
 		 476 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  42.68 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  36.12 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.37 
 
 		 528 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  42.18 
 
 		 523 aa  326  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  41.03 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  42.07 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  35.79 
 
 		 497 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  36 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  42.43 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.96 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  41.68 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  39.88 
 
 		 518 aa  289  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  41.75 
 
 		 502 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  41.67 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  40.52 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  41.4 
 
 		 473 aa  280  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  38.3 
 
 		 477 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  39.83 
 
 		 481 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  39.83 
 
 		 481 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  39.83 
 
 		 481 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.11 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  38.53 
 
 		 482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.88 
 
 		 485 aa  263  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  40.56 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  39.66 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.4 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.87 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  26.34 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.11 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  26.87 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  26.36 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.77 
 
 		 482 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  26.87 
 
 		 472 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  24.77 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  24.77 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  23.73 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  25 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.17 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  21.65 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  25 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1031  glycerol kinase  22.96 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00337606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.55 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  25.55 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  22.69 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.44 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  24.46 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3810  glycerol kinase  23.11 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0347635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  21.3 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.22 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3313  carbohydrate kinase FGGY  26.87 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000213969  normal  0.0641237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.15 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  24.53 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  24.52 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  29 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  22.54 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  22.77 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>