More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0425 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 472 aa  935    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  58.12 
 
 		 523 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  59.07 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  53.56 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  60.77 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  57.45 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  59.1 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  54.37 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  53.07 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  50.32 
 
 		 516 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  52.44 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  50.62 
 
 		 528 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  53.85 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  53.55 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  43.42 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  54.06 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  50.89 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  54.32 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  42.65 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  39.62 
 
 		 493 aa  398  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  38.25 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  56.36 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  48.89 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  43.85 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.69 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  51.78 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  51.78 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  51.78 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  44.47 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  45.09 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  48.39 
 
 		 473 aa  362  8e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  37.47 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  39.25 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  38.23 
 
 		 473 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  44.68 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  41.54 
 
 		 474 aa  351  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  41.33 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  45.01 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  42.34 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  42.34 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  41.91 
 
 		 485 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  42.34 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  42.13 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  42.13 
 
 		 489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  41.7 
 
 		 520 aa  336  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  37 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  43.27 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  44.88 
 
 		 518 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  38.15 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  40.54 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  40.09 
 
 		 489 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  40.09 
 
 		 489 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  40.09 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  40.09 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  40.3 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  39.87 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  39.87 
 
 		 489 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  40.09 
 
 		 489 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  40.52 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  35.19 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.97 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  56.69 
 
 		 579 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  38.2 
 
 		 482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  41.69 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  29.95 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25.5 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25.5 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.25 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.25 
 
 		 482 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.25 
 
 		 482 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.5 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25.5 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.25 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  27.07 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  27.07 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  27.07 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  26.8 
 
 		 472 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  20.69 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.41 
 
 		 502 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  30.93 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.23 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.98 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  29.75 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  28.61 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.55 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.68 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.13 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.18 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.94 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  23.63 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.49 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  20.54 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.71 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  25.61 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.87 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.87 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.33 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.33 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>