More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6710 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 488 aa  966    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  57.06 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  59.61 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  54.08 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  46.83 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  54.58 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  52.43 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  54.99 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  50.32 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  49.25 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  52.64 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  42.01 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  50.52 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  47.22 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  40.55 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  50.7 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  50 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  39.05 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  49.26 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  40.26 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  48.63 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  49.59 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  49.59 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  49.59 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  45.81 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  47.52 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  39.61 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  43.58 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  43.37 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  43.37 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  43.58 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  43.37 
 
 		 489 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  45.3 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  47.01 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  46.87 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  43.16 
 
 		 489 aa  359  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  48.28 
 
 		 518 aa  359  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  43.16 
 
 		 489 aa  359  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  43.37 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  44.54 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  45.73 
 
 		 479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  44.23 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  44.02 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  44.33 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  44.02 
 
 		 489 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  44.02 
 
 		 489 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  49.03 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  43.8 
 
 		 489 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  39.88 
 
 		 497 aa  349  8e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  46.15 
 
 		 496 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  37.81 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  38.64 
 
 		 498 aa  339  5.9999999999999996e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  43.62 
 
 		 472 aa  336  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  43.39 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  45.38 
 
 		 490 aa  329  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  38.69 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  38.27 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  38.12 
 
 		 467 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.77 
 
 		 470 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  36.17 
 
 		 485 aa  302  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  32.02 
 
 		 485 aa  275  9e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  37.37 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  43.83 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  54.98 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.98 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.87 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.87 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  27.23 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.87 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  21.95 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  27.23 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  27.23 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  27.23 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.98 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.69 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.69 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.69 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.44 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25.19 
 
 		 472 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.27 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  22.71 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  27.49 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  25.65 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  21.87 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  25.65 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  25.39 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  25.39 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.86 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  27.11 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  25 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  24.58 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  23.79 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.29 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  26.94 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  25.92 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  27.52 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  24.18 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  23.04 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.34 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.97 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>