More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1385 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 477 aa  920    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  54.69 
 
 		 523 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  57.45 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  52.94 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  54.41 
 
 		 488 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  56.33 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  45.74 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  52.89 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  50 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  48.99 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  48.87 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  51.78 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  53.06 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  53.68 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  53.06 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  53.06 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  48.84 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  46.2 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  49.37 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  51.4 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  48.95 
 
 		 499 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  47.09 
 
 		 485 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  38.17 
 
 		 489 aa  349  7e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  34.96 
 
 		 493 aa  345  8.999999999999999e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  36.17 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  38.72 
 
 		 498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.97 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  32.84 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  44.7 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  38.91 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  40.34 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  45.22 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  37.41 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  42.8 
 
 		 518 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  41.09 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  34.33 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.87 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  39.28 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  38.87 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  38.87 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  40.09 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.9 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  37.08 
 
 		 474 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  36.86 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  38.9 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  38.9 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  38.9 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  38.95 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  38.95 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  38.9 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  38.69 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  38.69 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  38.72 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  38.62 
 
 		 485 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  31.93 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  38.39 
 
 		 520 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  39.02 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  39.15 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.22 
 
 		 470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  37.16 
 
 		 472 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  28.48 
 
 		 485 aa  252  9.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  36.04 
 
 		 482 aa  227  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  49.48 
 
 		 579 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  38.91 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  28.31 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.55 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.3 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  31.58 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  31.33 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25.31 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.31 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.55 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.31 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  19.58 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  29.06 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  29.06 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  29.06 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.88 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.8 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  20.59 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2076  carbohydrate kinase, FGGY  26.86 
 
 		 500 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00125408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  26.56 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  31.28 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  22.65 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.94 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  27.81 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.7 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  27.11 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  29.53 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  26.22 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  26.64 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.82 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.15 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>