More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2989 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
473 aa  937    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  52.53 
 
 
495 aa  440  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  47.22 
 
 
516 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  38.4 
 
 
493 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  48.39 
 
 
472 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  44.4 
 
 
493 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  47.99 
 
 
523 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  49.03 
 
 
488 aa  347  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  41.6 
 
 
497 aa  346  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  44.35 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  38.25 
 
 
489 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  35.82 
 
 
500 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  46.43 
 
 
499 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  44.42 
 
 
480 aa  329  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  46.43 
 
 
528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  45.17 
 
 
499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  37.45 
 
 
476 aa  326  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  45.18 
 
 
485 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  38.49 
 
 
498 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  44.59 
 
 
477 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.47 
 
 
473 aa  318  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  45.01 
 
 
470 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  46.3 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  46.3 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  49.27 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  46.3 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  45.07 
 
 
499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  41.18 
 
 
479 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  47.47 
 
 
506 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  36.99 
 
 
467 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  44.4 
 
 
464 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  36.5 
 
 
497 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  43.09 
 
 
518 aa  292  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  46.61 
 
 
468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  33.76 
 
 
485 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  41.61 
 
 
496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  40.3 
 
 
490 aa  285  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  39.79 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  40.21 
 
 
496 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  41.23 
 
 
490 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  38.4 
 
 
489 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  38.4 
 
 
489 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  38.19 
 
 
489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  38.19 
 
 
489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  38.19 
 
 
489 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  38.4 
 
 
489 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  38.53 
 
 
489 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  38.53 
 
 
489 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  38.53 
 
 
489 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  36.4 
 
 
474 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  37.97 
 
 
489 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.53 
 
 
489 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  37.97 
 
 
489 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  36.09 
 
 
476 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.24 
 
 
470 aa  270  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  39.07 
 
 
520 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  39.1 
 
 
485 aa  259  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40 
 
 
490 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.85 
 
 
485 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  38.37 
 
 
472 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  36.19 
 
 
482 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  39.94 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  43.53 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26 
 
 
482 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26 
 
 
472 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26 
 
 
482 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26 
 
 
472 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26 
 
 
472 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26 
 
 
472 aa  113  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.76 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  27.79 
 
 
472 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  27.54 
 
 
472 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  27.54 
 
 
472 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  26.55 
 
 
472 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  27.3 
 
 
472 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.7 
 
 
474 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3131  carbohydrate kinase FGGY  23.86 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  21.58 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  28.48 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  28.8 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.36 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.81 
 
 
505 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.98 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.98 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  27.8 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.06 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  26.42 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.5 
 
 
556 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.9 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  26.09 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.67 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.2 
 
 
496 aa  73.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  27.96 
 
 
498 aa  73.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.43 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.13 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.13 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  27.62 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  27.62 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>