More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4382 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  99.05 
 
 		 489 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  93.84 
 
 		 489 aa  658    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  99.05 
 
 		 489 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  99.05 
 
 		 489 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  93.84 
 
 		 489 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  100 
 
 		 471 aa  979    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  97.79 
 
 		 489 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  93.84 
 
 		 489 aa  658    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  99.37 
 
 		 489 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  79.5 
 
 		 489 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  79.5 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  79.5 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  79.5 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  78.86 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  75.66 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  64.86 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  65.16 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  61.2 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  64.09 
 
 		 472 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  60.88 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  58.68 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  58.36 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.74 
 
 		 274 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.11 
 
 		 274 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.11 
 
 		 274 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.11 
 
 		 274 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  97.48 
 
 		 274 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  97.48 
 
 		 274 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  97.48 
 
 		 274 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  96.86 
 
 		 274 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.82 
 
 		 275 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.82 
 
 		 275 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.82 
 
 		 275 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.82 
 
 		 275 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.82 
 
 		 275 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  89.94 
 
 		 276 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  77.07 
 
 		 276 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  77.07 
 
 		 274 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  77.07 
 
 		 274 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  44.3 
 
 		 467 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  74.52 
 
 		 274 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  71.34 
 
 		 274 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  71.34 
 
 		 274 aa  243  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  71.34 
 
 		 274 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  39.94 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  44.95 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  42.09 
 
 		 493 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  41.9 
 
 		 485 aa  233  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  43.63 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  42.12 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  41.12 
 
 		 500 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  42.81 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  36.42 
 
 		 476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  41 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  41.99 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  40.13 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  41.96 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  41.69 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  38.32 
 
 		 498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  41.4 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  44.34 
 
 		 488 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  39.35 
 
 		 499 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  42.72 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  39.34 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  42.48 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  40.26 
 
 		 499 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.7 
 
 		 528 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  38.69 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  38.06 
 
 		 489 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  57.23 
 
 		 274 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  37.61 
 
 		 518 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  42.09 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  38.42 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  37.58 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  38.91 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  34.87 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.44 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  39.68 
 
 		 470 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  39.94 
 
 		 473 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  37.27 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  37.27 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  37.27 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  33.02 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  37.05 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  37.86 
 
 		 502 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  41.22 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  34.48 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  30.05 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  29.85 
 
 		 474 aa  86.7  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  24.71 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.8 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.8 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.71 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  29.21 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.71 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.51 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  29.21 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  29.21 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>