49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0745 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 
274 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 
274 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  99.64 
 
 
274 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  79.78 
 
 
276 aa  457  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  78.68 
 
 
274 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  79.41 
 
 
274 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  78.31 
 
 
274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  68.38 
 
 
274 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  68.38 
 
 
274 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  68.38 
 
 
274 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  68.01 
 
 
274 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  67.65 
 
 
274 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  66.67 
 
 
276 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  67.65 
 
 
274 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  67.65 
 
 
274 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  68.01 
 
 
274 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 
275 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 
275 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 
275 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 
275 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 
275 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.14 
 
 
274 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  71.34 
 
 
471 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.17 
 
 
301 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.8 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.35 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.04 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.49 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  25.32 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  26.01 
 
 
215 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  27.65 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  25.73 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  24.34 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  26.32 
 
 
427 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  24.69 
 
 
212 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  27.45 
 
 
227 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  23.36 
 
 
214 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  25.89 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  27.27 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  25 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  31.37 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  21.91 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  22.78 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  25 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  23.42 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  29.41 
 
 
180 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  20.7 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  27.61 
 
 
243 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  27.61 
 
 
231 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>