232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1672 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  96.61 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  34.45 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.13 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.14 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.02 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.02 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.02 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.02 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.02 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.19 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.47 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.49 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.49 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.49 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.2 
 
 		 276 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.33 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.9 
 
 		 287 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.51 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.71 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  27.82 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  34.46 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  34.3 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  30.33 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  32.96 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  30.53 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  26.99 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  26.34 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  29.73 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  35.82 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  29.24 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  26.98 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  27.35 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  28.64 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  34.15 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  30.57 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  26.03 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  27.91 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  26.48 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  26.29 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  29.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  28.04 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  26.24 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  26.22 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  27.65 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  27.27 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  31.3 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  27.36 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  29.66 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  27.94 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  30.66 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.11 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  23.04 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  30.09 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  30.73 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  31.37 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  27.09 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  28.22 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  27.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  25.23 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.68 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  26.39 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  28 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  27.16 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  24.45 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  27.66 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  26.79 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  27.4 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  25.99 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  27.88 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  27.86 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  26.27 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  25.46 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  26.94 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  24.58 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  29.71 
 
 		 428 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  27.83 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  27.98 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  26.22 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  28.99 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  30.22 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  27.4 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  26.48 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  24.48 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  27.27 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  26.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  25.81 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  23.98 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  26.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  23.92 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>