More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0321 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  81.99 
 
 
261 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  76.65 
 
 
257 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  71.76 
 
 
263 aa  377  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  66.67 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  66.8 
 
 
263 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  65.35 
 
 
263 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  64.89 
 
 
268 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  64.62 
 
 
262 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  65.35 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  47.26 
 
 
205 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  43.72 
 
 
254 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  50.51 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  48.21 
 
 
246 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  46.8 
 
 
227 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  50.53 
 
 
246 aa  175  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  47.87 
 
 
242 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  40.69 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  41.67 
 
 
249 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  35.62 
 
 
242 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  35 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  36.32 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  38.26 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  37.26 
 
 
254 aa  135  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  36.82 
 
 
251 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.98 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  34.98 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.62 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  38.08 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  37.96 
 
 
257 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  37.44 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  38.05 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  36.92 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  36.73 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  34.63 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  37.39 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  38.01 
 
 
271 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  36.19 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  34.8 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  35.75 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  36.24 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  34.63 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  36.02 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  36 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  33.33 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.63 
 
 
262 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  34.08 
 
 
243 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  36.84 
 
 
259 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  33.47 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  35.55 
 
 
256 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  35.81 
 
 
244 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  34.47 
 
 
263 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  37.07 
 
 
259 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  32.78 
 
 
259 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
265 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  34.25 
 
 
251 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 
258 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  36.45 
 
 
241 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  36.36 
 
 
259 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  33.8 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  35.48 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  35.35 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  32.19 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  36.57 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  32.93 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  32.35 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  33.19 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.17 
 
 
251 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  35.47 
 
 
277 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  37.97 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  36.36 
 
 
322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  34.39 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  32.63 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  36.36 
 
 
331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  33.96 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  36.59 
 
 
263 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  33.91 
 
 
252 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  34.45 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  35.61 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  38.55 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  34.86 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  35.71 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  33.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  36.84 
 
 
283 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  32.65 
 
 
277 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  30.91 
 
 
255 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 
255 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 
255 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  36.1 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  37.22 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  35.14 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  31.28 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  33.17 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  28.98 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  34.27 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>