More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1413 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  91.46 
 
 
277 aa  524  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  90.67 
 
 
268 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  87.59 
 
 
282 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  87.23 
 
 
282 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  63.49 
 
 
253 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  63.45 
 
 
263 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  58.5 
 
 
271 aa  311  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  57.96 
 
 
260 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  62.04 
 
 
244 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  55.98 
 
 
280 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  53.71 
 
 
301 aa  285  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  53.01 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  51.38 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  50.55 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  57.61 
 
 
271 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  55.1 
 
 
274 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  53.68 
 
 
279 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  54.65 
 
 
279 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  52.94 
 
 
281 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  54.65 
 
 
279 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  52.57 
 
 
279 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  52.57 
 
 
279 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  52.57 
 
 
279 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  49.01 
 
 
268 aa  262  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  57.38 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  52.94 
 
 
281 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  51.84 
 
 
279 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  52.33 
 
 
274 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  50.2 
 
 
298 aa  254  9e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  47.84 
 
 
286 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  47.24 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  47.64 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  45.28 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  46.13 
 
 
312 aa  236  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  56.91 
 
 
326 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  44.44 
 
 
276 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  41.38 
 
 
274 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  40.64 
 
 
260 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  39.72 
 
 
256 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  52 
 
 
205 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  37.07 
 
 
256 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  36.17 
 
 
262 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  40.38 
 
 
261 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  37.8 
 
 
256 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.36 
 
 
282 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.6 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  39.71 
 
 
261 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  34.44 
 
 
257 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  39.3 
 
 
263 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  39.5 
 
 
263 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  34.92 
 
 
263 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  37.07 
 
 
252 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.26 
 
 
257 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  37.3 
 
 
267 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  35.41 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  39.9 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  36.94 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  37.02 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  36.09 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  35.18 
 
 
262 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 
259 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  37.25 
 
 
258 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  36.11 
 
 
264 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  35.75 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  38.27 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  35.25 
 
 
258 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  38.59 
 
 
254 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.25 
 
 
258 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  38.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  35.84 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  35.96 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  35.96 
 
 
263 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  40.86 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  38.38 
 
 
250 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  36.08 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.82 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  37.17 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.84 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  36.7 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  36.36 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 
237 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  33.47 
 
 
277 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  34.17 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  36.49 
 
 
262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  35.44 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  36.13 
 
 
251 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  34.47 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  34.47 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  35.02 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  36.1 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  33.76 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  36.87 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  35.02 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  33.97 
 
 
257 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  36.49 
 
 
261 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  31.1 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>