More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1547 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  78.44 
 
 
271 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  68.52 
 
 
274 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  72.48 
 
 
279 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  72.48 
 
 
279 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  72.09 
 
 
281 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  72.09 
 
 
281 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  72.09 
 
 
279 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  72.09 
 
 
279 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  72.09 
 
 
279 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  72.48 
 
 
279 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  70.66 
 
 
279 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  62.7 
 
 
260 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  62.92 
 
 
253 aa  328  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  61.02 
 
 
280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  57.77 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  60 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  61.23 
 
 
263 aa  292  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  56.05 
 
 
268 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  56.15 
 
 
282 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  55.79 
 
 
277 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  55.33 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  55.1 
 
 
281 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  52.5 
 
 
271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  57.56 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  51.29 
 
 
271 aa  241  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  53.48 
 
 
301 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  60.54 
 
 
326 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  50.21 
 
 
312 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  48.35 
 
 
301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  46.09 
 
 
298 aa  219  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  48.09 
 
 
268 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  42.8 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  43.09 
 
 
280 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  41.56 
 
 
279 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  42.92 
 
 
287 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  45 
 
 
260 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  40.89 
 
 
274 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  42.19 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  39.39 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  40.65 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  37.86 
 
 
256 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  42.36 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  37.73 
 
 
256 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  37.24 
 
 
282 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  37.3 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  42.57 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  36.9 
 
 
258 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  40.2 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  37.25 
 
 
264 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  40.58 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  36.51 
 
 
258 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  38.42 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  37.9 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  37.76 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  38.27 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  36.24 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  40.71 
 
 
263 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  36.51 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  38.35 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  35.78 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  41.15 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  41.03 
 
 
264 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.12 
 
 
266 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  39.89 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  40.58 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  37.79 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.96 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.68 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  37.33 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  45.7 
 
 
205 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  33.79 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  39.34 
 
 
257 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  36.21 
 
 
263 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  34.94 
 
 
322 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  34.94 
 
 
331 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  37.75 
 
 
267 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  39.49 
 
 
251 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  35.24 
 
 
260 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  36.62 
 
 
264 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  35.98 
 
 
268 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  38.38 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  37.62 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  38.46 
 
 
251 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 
250 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  34.19 
 
 
262 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  39.18 
 
 
251 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  32.9 
 
 
260 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  36.23 
 
 
259 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.33 
 
 
251 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  34.03 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  34.5 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  34.78 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  36.04 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  36.27 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  34.98 
 
 
250 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34.03 
 
 
255 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34.03 
 
 
255 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>