More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5234 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  78.44 
 
 		 274 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  72.31 
 
 		 274 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  68.13 
 
 		 279 aa  344  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  68.13 
 
 		 279 aa  344  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  70.3 
 
 		 279 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  67.08 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  69.17 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  69.17 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  69.55 
 
 		 279 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  69.55 
 
 		 279 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  69.55 
 
 		 279 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  67.67 
 
 		 279 aa  335  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  61.79 
 
 		 260 aa  321  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  60.8 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  58.37 
 
 		 268 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  55.81 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  59.09 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  57.55 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  56.79 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  56.73 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  59.91 
 
 		 263 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  57.61 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  56.43 
 
 		 244 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  62.7 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  47.5 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  53.69 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  50.64 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  49.15 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  46.09 
 
 		 298 aa  217  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  46.89 
 
 		 301 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  45.99 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  42.32 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  42.47 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  39.92 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  41.06 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  44.03 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  41.42 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  36.68 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  43.3 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  37.98 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  37.74 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  40.96 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  34.63 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.56 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.12 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  35.27 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 		 205 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.14 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  37.56 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.24 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  36.12 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  39.15 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  36 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  37.3 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  37.44 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  34.8 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  37.11 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  37.66 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  35.35 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  36.15 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  35.94 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  37.11 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  31.66 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.21 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  35.34 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  36.06 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  37.19 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  36.02 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  37.95 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  37.7 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  33.47 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  34.33 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  37.72 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  35.34 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  33.76 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  33.76 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  35.91 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  34.13 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  33.17 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  34.91 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.17 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  33.64 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  41.04 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  37.37 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  35.53 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  35.53 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  34.91 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  33.01 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  32.55 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  35.02 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  32.91 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  32.91 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  33.62 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  34.67 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  34.6 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  36.1 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>