More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4082 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  74.19 
 
 
279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  68.94 
 
 
286 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  67.03 
 
 
287 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  50.39 
 
 
268 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  50.39 
 
 
282 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  48.62 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  49.61 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  48.03 
 
 
277 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  45.6 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  47.64 
 
 
281 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  48.35 
 
 
260 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  47.04 
 
 
263 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  44.22 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  44.4 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  45.04 
 
 
268 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  42.74 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  40.87 
 
 
283 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  43.53 
 
 
301 aa  208  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  44.67 
 
 
301 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  45.23 
 
 
244 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  41.61 
 
 
281 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  40.91 
 
 
281 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  43.09 
 
 
274 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  41.28 
 
 
279 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  41.28 
 
 
279 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  40.91 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  40.91 
 
 
279 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  40.91 
 
 
279 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  40.91 
 
 
279 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  41.61 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  42.32 
 
 
271 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  40.14 
 
 
274 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  36.9 
 
 
298 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  45.81 
 
 
326 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  40.08 
 
 
312 aa  176  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
274 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  34.51 
 
 
276 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  34.82 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  33.81 
 
 
256 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  31.33 
 
 
256 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  34.47 
 
 
282 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  33.67 
 
 
263 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  30.47 
 
 
258 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  34.27 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  31.71 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  33.01 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  34.92 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  29.75 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  31.32 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  31.28 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  29.24 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  32.84 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  32.46 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  31.28 
 
 
260 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  30.74 
 
 
257 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  29.37 
 
 
277 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
205 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  31.41 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  34.13 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  32 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  31.63 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  32.11 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.77 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  30.62 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  32.69 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  32.28 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  30.99 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 
263 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  30.36 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  31.46 
 
 
259 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  30.62 
 
 
264 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  31.71 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  28.14 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  29.03 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  27.19 
 
 
244 aa  85.9  7e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  34.12 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  26 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  34.71 
 
 
264 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  30.96 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  29.17 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  26.92 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  26.72 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  32.98 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  28.92 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  31.22 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  32.18 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  32.18 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  30.73 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  30.85 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  30.14 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  31.34 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  31.84 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  29.06 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  26.38 
 
 
260 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>