More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1569 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  98.46 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  98.08 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  78.76 
 
 		 260 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  78.99 
 
 		 259 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  78.38 
 
 		 260 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  77.31 
 
 		 260 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  70.38 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  71.37 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  70 
 
 		 260 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  70.38 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  70 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  70 
 
 		 260 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  70 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  70.38 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  71.04 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  68.34 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  70.66 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  70.66 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  70.66 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  70.66 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  65.22 
 
 		 258 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  60.55 
 
 		 258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  52.12 
 
 		 260 aa  288  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  35.65 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  34.62 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  39.39 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  31.23 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  32.75 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  30.51 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  32.34 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  32.34 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  36.45 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  34.5 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  30.04 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  34.56 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  31.91 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  36.08 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  31.86 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  33.16 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  30.6 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  35.29 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  34.12 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  35.4 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  33.64 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  33.83 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  33.63 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  33.63 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  33.63 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  33.63 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  30.8 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  27.93 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  32.86 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  37.43 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  32.86 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  32.3 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  33.19 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  29.02 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  32.21 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  31.79 
 
 		 205 aa  92.8  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  32.11 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  30.8 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  29.34 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  31.22 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  32.35 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  28.51 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  28.72 
 
 		 312 aa  88.6  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  31.16 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  27.27 
 
 		 214 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  31.37 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  29.17 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  28.64 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  29.15 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  29.33 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.04 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  28.7 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  30.09 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  31.44 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  31.44 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  28.25 
 
 		 286 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  26.05 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  30.92 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  27.01 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  29.95 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  30.43 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  29.65 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.19 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  28.86 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  28.7 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  26.57 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  28.25 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  30.32 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>