291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2516 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  57.81 
 
 
253 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  57.45 
 
 
268 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  52.31 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  60.54 
 
 
260 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  52.31 
 
 
282 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  62.9 
 
 
280 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  56.91 
 
 
281 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  55.85 
 
 
277 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  62.7 
 
 
271 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  57.37 
 
 
283 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  58.06 
 
 
263 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  57.14 
 
 
301 aa  222  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  58.38 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  60.54 
 
 
274 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  51.32 
 
 
271 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  59.16 
 
 
274 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  59.34 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  58.33 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  56.63 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  56.63 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  46.58 
 
 
301 aa  212  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  57.81 
 
 
279 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  57.81 
 
 
279 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  57.81 
 
 
279 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  57.81 
 
 
281 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  57.81 
 
 
279 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  54.46 
 
 
279 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  50.52 
 
 
271 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  48.7 
 
 
268 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  46.63 
 
 
312 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  46.35 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  45.81 
 
 
280 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  46.43 
 
 
298 aa  176  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  45.16 
 
 
274 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  45.5 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  42.54 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  41.99 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  38.86 
 
 
260 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  45.81 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  44.31 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  39.89 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  42.01 
 
 
263 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  39.79 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  43.33 
 
 
256 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  42.61 
 
 
251 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  41.48 
 
 
252 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  42.61 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  39.56 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  40.8 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  40.23 
 
 
252 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  38.46 
 
 
262 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  45 
 
 
205 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  46.94 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  38.55 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  42.07 
 
 
267 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  39.2 
 
 
259 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.19 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  37.57 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  37.29 
 
 
237 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  42.01 
 
 
331 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  42.01 
 
 
322 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  39.29 
 
 
263 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  38.51 
 
 
262 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  46.26 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  38.64 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  33.06 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  35.23 
 
 
268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  42.01 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  38.2 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  39.33 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  37.85 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  35.65 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  39.31 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  35.65 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  46.94 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  38.76 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  41.57 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  41.05 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  35.22 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  37.58 
 
 
263 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  40.45 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  39.11 
 
 
258 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  36.56 
 
 
263 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  41.18 
 
 
259 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  36.14 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  38.1 
 
 
256 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  37.91 
 
 
246 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  41.62 
 
 
255 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  37.91 
 
 
251 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  37.82 
 
 
259 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  39.01 
 
 
260 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  38.34 
 
 
260 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  37.43 
 
 
264 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.91 
 
 
263 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  38.6 
 
 
260 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  38.64 
 
 
259 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  36.31 
 
 
257 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>