More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0233 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  46.61 
 
 
253 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  46.12 
 
 
263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  43.82 
 
 
268 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  46.19 
 
 
260 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  42.23 
 
 
277 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  45 
 
 
274 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  41.96 
 
 
282 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  42.35 
 
 
282 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  42.23 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  41.46 
 
 
271 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  42.8 
 
 
283 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  43.22 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  42.21 
 
 
280 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  41.42 
 
 
271 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  42.63 
 
 
281 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  40.08 
 
 
271 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  42.23 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  42.13 
 
 
301 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  41.43 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  41.43 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  41.43 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  41.83 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  41.04 
 
 
279 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  38.34 
 
 
259 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  39.37 
 
 
279 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  39.37 
 
 
279 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  36.72 
 
 
298 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  38.8 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  39.11 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  34.72 
 
 
301 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  38.11 
 
 
286 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  38.15 
 
 
287 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  34.8 
 
 
274 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  36.07 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  34.82 
 
 
280 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  33.87 
 
 
279 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  36.63 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  38.86 
 
 
326 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  33.03 
 
 
282 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  33.95 
 
 
263 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  35.1 
 
 
263 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  31.3 
 
 
259 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  30.36 
 
 
260 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34 
 
 
255 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34 
 
 
255 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  34.38 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  32.14 
 
 
256 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  32 
 
 
258 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  30.04 
 
 
256 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  33.01 
 
 
257 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  30.95 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  33.33 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  35.18 
 
 
262 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  31.63 
 
 
257 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  30.48 
 
 
260 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  31.6 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  28.87 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  30.48 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  30.48 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  30.33 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  29.2 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  30.25 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.52 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  30.29 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  28.5 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  31.53 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  30 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  32.56 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  28.9 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  31.53 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  31.53 
 
 
322 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  33.85 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  30.29 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  30.29 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  30.09 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  30.29 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  30.67 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  30.95 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  30.62 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  30.29 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  31.19 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  27.93 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  28.95 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  32.8 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  31.11 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  28.97 
 
 
260 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  29.41 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  30.35 
 
 
251 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  29.71 
 
 
264 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  30.26 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  28.97 
 
 
260 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  31.88 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  30.35 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  31.25 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  29.3 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>