More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1545 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  74.19 
 
 		 280 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  68.06 
 
 		 286 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  67.05 
 
 		 287 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  46.85 
 
 		 282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  44.09 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  45.28 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  43.78 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  46.06 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  44.09 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  45.67 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  45.28 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  45.17 
 
 		 263 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  44.62 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  43.57 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  41.02 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  44.35 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  44.44 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  40.22 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  38.52 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  42.02 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  41.56 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  39.71 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  39.71 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  41.96 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  41.96 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  41.57 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  41.96 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  41.57 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  41.96 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  41.18 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  46.35 
 
 		 326 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  39.26 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  42.47 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  38.52 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  36.82 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  30.65 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  33.87 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  33.18 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  30.86 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  31.93 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  34.85 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  33.88 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  33.64 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  32.51 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  33.47 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  28.94 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  29.41 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  28.94 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  27.93 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  31.34 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  27.48 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  31.07 
 
 		 236 aa  99.4  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  30.56 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  31.6 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  27.93 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  34.78 
 
 		 251 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  31.31 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  35.64 
 
 		 251 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  32.06 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  29.38 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  29.86 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  28.57 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  30.56 
 
 		 257 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  27.97 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  29.28 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  30.49 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  30.09 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  27.96 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.77 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  29.72 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  31.91 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  28.87 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  34.81 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.29 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  35.88 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  30.04 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  32.18 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  27.96 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  33.16 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  31.37 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  33.51 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  27.47 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  25.29 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  32.04 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  26.94 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  27.75 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  28.7 
 
 		 262 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  30.4 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  29.03 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  28.65 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  29.65 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  28.95 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  29.77 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  29.72 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  28.95 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  28.95 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>