More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4460 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  83.99 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  83.87 
 
 		 279 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  83.51 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  83.63 
 
 		 281 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  83.51 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  83.51 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  82.8 
 
 		 279 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  77.7 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  72.48 
 
 		 274 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  68.13 
 
 		 271 aa  345  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  60.41 
 
 		 260 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  58.8 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  58.73 
 
 		 280 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  55.86 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  55.29 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  54.26 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  51.44 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  51.44 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  54.88 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  54.65 
 
 		 281 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  55.26 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  54.36 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  45.91 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  56.63 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  48.5 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  47.9 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  44.22 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  41.28 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  48.47 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  42.04 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  39.71 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  42.21 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  45.78 
 
 		 301 aa  201  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  41.94 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  42.28 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  39.61 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  39.37 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  33.78 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  38.96 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.75 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  36.99 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  36.03 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  34.9 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  36.17 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  37.27 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  37.82 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  37.73 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  34.15 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  36.67 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  35.75 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.71 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.71 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  36.28 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  35.92 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  32.87 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  34.33 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  33.47 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  31.89 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  31.45 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  31.45 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  34.58 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.64 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  33.8 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  34.05 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  33.9 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  33.9 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  33.8 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  35.24 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  34.06 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.22 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  33.66 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  33.73 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  34.76 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  37.81 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  33.98 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  33.19 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  32.86 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  33.47 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  32.84 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  32.86 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  32.86 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  33.02 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  32.57 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  32.29 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  32.07 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  32.87 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  32.38 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  30 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.05 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  31.06 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  31.58 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>