296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3892 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  90.56 
 
 
287 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  68.06 
 
 
279 aa  394  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  68.94 
 
 
280 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  48.63 
 
 
282 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  47.45 
 
 
277 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  47.84 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  47.84 
 
 
281 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  46.27 
 
 
268 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  44.8 
 
 
253 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  42.32 
 
 
271 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  43.67 
 
 
260 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  42.97 
 
 
263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  45.64 
 
 
244 aa  212  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  41.2 
 
 
268 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  42.68 
 
 
301 aa  205  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  39.05 
 
 
280 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  40.32 
 
 
259 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  42.68 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  39.27 
 
 
283 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  37.94 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  42.8 
 
 
274 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  41.67 
 
 
279 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  42.04 
 
 
279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  40 
 
 
274 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  42.04 
 
 
279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  37.6 
 
 
298 aa  185  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  40.53 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  40.53 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  40.53 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  40.15 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  39.39 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  39.77 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  37.25 
 
 
312 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  39.92 
 
 
271 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  42.54 
 
 
326 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  38.11 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  32.96 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  31.37 
 
 
274 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  32.66 
 
 
205 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  30.47 
 
 
256 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  34.34 
 
 
256 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  35.05 
 
 
256 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.49 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  31.49 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  32.73 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  33.33 
 
 
261 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  31.31 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  32.55 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  30.56 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  31.62 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  31.6 
 
 
282 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  32.19 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.93 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  30.22 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  30.08 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  29.63 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  33.67 
 
 
257 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  34.8 
 
 
258 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  30.49 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  30.17 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  30.34 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  33 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4246  class II aldolase/adducin family protein  32.87 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  31.28 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  29.76 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  32.11 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  29.29 
 
 
246 aa  89.7  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  33 
 
 
257 aa  89  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  28.51 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  30.19 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  28.14 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  30.85 
 
 
257 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  32.04 
 
 
250 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  32.04 
 
 
322 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  32.8 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  28.69 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  30.59 
 
 
267 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  33.84 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  33.52 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  30.96 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  31.55 
 
 
331 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  32.29 
 
 
251 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  28.25 
 
 
260 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  31.28 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  27.66 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  28.76 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  33.18 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  28.25 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  28.69 
 
 
252 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  31.66 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  30.99 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  31.07 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  27.35 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  30.39 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  31.44 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  31.63 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  26.57 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  30.66 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>