233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0901 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Plasmid clonability

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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  85.94 
 
 
259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  84.74 
 
 
259 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  81.78 
 
 
261 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  65.06 
 
 
255 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  64.66 
 
 
250 aa  340  9e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  63.45 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  65.71 
 
 
331 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  65.71 
 
 
322 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  63.14 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  65.71 
 
 
250 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  65.98 
 
 
250 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  64.43 
 
 
255 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  64.43 
 
 
255 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  62.4 
 
 
256 aa  322  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  63.64 
 
 
255 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  64.03 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  57.41 
 
 
264 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  58.8 
 
 
256 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  58.8 
 
 
252 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  55.82 
 
 
257 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  53.85 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  54.58 
 
 
256 aa  287  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  56.18 
 
 
255 aa  287  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  55.38 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  55.38 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  55.2 
 
 
255 aa  281  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  53.41 
 
 
259 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  51.75 
 
 
259 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  51.36 
 
 
259 aa  274  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  49.42 
 
 
258 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  49.03 
 
 
255 aa  254  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  49.42 
 
 
258 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  48.26 
 
 
258 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  50.83 
 
 
263 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  50.83 
 
 
282 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  49.42 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  43.56 
 
 
264 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  49.43 
 
 
257 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  49.43 
 
 
257 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  50.94 
 
 
264 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  48.78 
 
 
252 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  47.18 
 
 
246 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  46.94 
 
 
259 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  48.13 
 
 
257 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  48.36 
 
 
252 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  46.53 
 
 
257 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  47.06 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  50 
 
 
271 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  44.62 
 
 
266 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  50.76 
 
 
264 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  45.63 
 
 
259 aa  221  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  49.21 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  46.48 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  44.87 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  53.06 
 
 
251 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  47.06 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  43.77 
 
 
262 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  46.79 
 
 
261 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  47.17 
 
 
261 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  45.8 
 
 
267 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  48.08 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  48.08 
 
 
257 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  46.04 
 
 
261 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  45.19 
 
 
261 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  46.94 
 
 
257 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  45.15 
 
 
261 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  50.61 
 
 
258 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  44.35 
 
 
251 aa  201  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  39.27 
 
 
254 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  46.86 
 
 
237 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  39.84 
 
 
263 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  38.7 
 
 
263 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  39.43 
 
 
254 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  40.65 
 
 
257 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  41.06 
 
 
260 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  40.24 
 
 
257 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  40.24 
 
 
257 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  38.78 
 
 
265 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  39.42 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  40.24 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  39.84 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  40.24 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  45.38 
 
 
265 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  39.02 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  39.02 
 
 
256 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  35.38 
 
 
277 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  43.32 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  38.62 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  37.4 
 
 
258 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  37.4 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  37.4 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  36.9 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
258 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
258 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
258 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
258 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  42.41 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  36.51 
 
 
274 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 
250 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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