236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3281 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  82.44 
 
 		 259 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  81.68 
 
 		 259 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  81.78 
 
 		 260 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  67.19 
 
 		 250 aa  351  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  63.35 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  62.55 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  60.96 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  61.32 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  63.2 
 
 		 255 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  63.2 
 
 		 255 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  60 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  62.4 
 
 		 255 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  63.93 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  62.8 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  63.93 
 
 		 331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  61.45 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  59.3 
 
 		 256 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  63.93 
 
 		 250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  63.33 
 
 		 250 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  57.36 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  57.14 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  56.45 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  56.86 
 
 		 259 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  57.26 
 
 		 255 aa  288  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  56.85 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  55.69 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  57.14 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  54.12 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  57.31 
 
 		 258 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  50 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  52.87 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  52.87 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  52.07 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  51.18 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  51.88 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  47.49 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  50.2 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  50 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  48.56 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  45.02 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  58.16 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  46.51 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  58.16 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  48.19 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  52.05 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  46.72 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  52.36 
 
 		 271 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  48.81 
 
 		 257 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  46.12 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  51.59 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  48.97 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  44.76 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  49.43 
 
 		 257 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  48.56 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  48.54 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  48.81 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  54.12 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  49.2 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  50.38 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  50.82 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  48.56 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  46.5 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  48 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  46.64 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  41.53 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  39.67 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  38.4 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  40.74 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  39.11 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  48.81 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  39.85 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  39.06 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  39.06 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  38.33 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  43.5 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  38.67 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  38.28 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  41.32 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  39.44 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  39.29 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  40.24 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  38.28 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  38.28 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  37.31 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  42.5 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  37.89 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2702  class II aldolase/adducin family protein  35.59 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00187501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>