254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3366 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  100 
 
 
250 aa  522  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  74.19 
 
 
251 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  67.19 
 
 
261 aa  351  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  67.46 
 
 
259 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  67.06 
 
 
259 aa  347  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  66.8 
 
 
255 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  66.8 
 
 
255 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  60 
 
 
256 aa  344  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  67.74 
 
 
255 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  65.18 
 
 
255 aa  341  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  64.66 
 
 
260 aa  340  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  61.04 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  60.89 
 
 
256 aa  334  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  58.82 
 
 
264 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  61.04 
 
 
257 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  61.69 
 
 
252 aa  327  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  61 
 
 
250 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  62.24 
 
 
250 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  62.24 
 
 
322 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  61.83 
 
 
331 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  58.89 
 
 
256 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  58.8 
 
 
258 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  57.09 
 
 
258 aa  301  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  55.16 
 
 
259 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  56.73 
 
 
259 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  55.42 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  55.42 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  52.78 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  52.94 
 
 
260 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  53.78 
 
 
256 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  51.61 
 
 
255 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  48.8 
 
 
264 aa  263  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  51.39 
 
 
251 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  58.33 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  53.11 
 
 
259 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  50.62 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  50.62 
 
 
258 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  50.62 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  50.41 
 
 
257 aa  248  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  52.23 
 
 
252 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  51.01 
 
 
252 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  48.82 
 
 
266 aa  244  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  50.83 
 
 
256 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  47.92 
 
 
259 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  46.67 
 
 
262 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  47.93 
 
 
282 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  49.17 
 
 
246 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  50 
 
 
257 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  47.06 
 
 
262 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  48.75 
 
 
261 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  50.4 
 
 
271 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  50.62 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  50.62 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  50 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  50.21 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  48.79 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  53.14 
 
 
263 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  49.79 
 
 
267 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  48 
 
 
257 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  50.4 
 
 
261 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  49.21 
 
 
264 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  51.21 
 
 
261 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  52.67 
 
 
258 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  50.41 
 
 
257 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  45.38 
 
 
251 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  49.6 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  46.83 
 
 
264 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  43.53 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  50.21 
 
 
257 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  42.92 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  42.92 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  42.92 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  42.92 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  42.5 
 
 
257 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  42.5 
 
 
257 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  43.8 
 
 
257 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  43.44 
 
 
258 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  41.15 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  38.52 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  42.21 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  42.21 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  41.8 
 
 
258 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  41.8 
 
 
258 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  41.8 
 
 
258 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  41.8 
 
 
258 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  40.39 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  41.5 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  40.57 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  42.86 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 
274 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  40.73 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  39.83 
 
 
254 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  42.46 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  38.68 
 
 
254 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  47.35 
 
 
265 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  38.28 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  37.8 
 
 
277 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  36.75 
 
 
250 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  37.67 
 
 
253 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  38.46 
 
 
250 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>