More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4873 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  83.66 
 
 
259 aa  447  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  78.99 
 
 
258 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  78.99 
 
 
258 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  78.6 
 
 
258 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  77.91 
 
 
257 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  77.91 
 
 
257 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  78.21 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  71.32 
 
 
257 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  78.68 
 
 
257 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  70.93 
 
 
257 aa  348  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  69.96 
 
 
261 aa  337  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  70.72 
 
 
261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  69.96 
 
 
261 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  52.67 
 
 
250 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  53.09 
 
 
258 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  52.87 
 
 
255 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  52.8 
 
 
255 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  52.8 
 
 
255 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  53.09 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  51.85 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  51.64 
 
 
255 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  49.79 
 
 
255 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  51.04 
 
 
256 aa  241  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  51.98 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  51.48 
 
 
250 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  50 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  51.04 
 
 
322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  51.04 
 
 
331 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  51.04 
 
 
250 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  53.28 
 
 
252 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  50.38 
 
 
261 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  50.61 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  51.98 
 
 
251 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  50.8 
 
 
264 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  49.39 
 
 
259 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  50.62 
 
 
263 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  50.6 
 
 
260 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  50.21 
 
 
251 aa  234  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  52.87 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  48.57 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  53.06 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  49.39 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  48.29 
 
 
259 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  51.61 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  49.02 
 
 
282 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  50.4 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  49.59 
 
 
256 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  52.08 
 
 
267 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  48.37 
 
 
259 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  49.2 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  47.93 
 
 
257 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  47.93 
 
 
257 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  47.93 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  47.52 
 
 
257 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  47.11 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  47.11 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  48.81 
 
 
262 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  45.34 
 
 
262 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  46.69 
 
 
257 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  46.43 
 
 
258 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  47.54 
 
 
255 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  45.31 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  50.81 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  48.75 
 
 
259 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  44.62 
 
 
255 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  45.9 
 
 
255 aa  214  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  50.39 
 
 
271 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  46.27 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  46.27 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  45.85 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  49.58 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  46.28 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  52.03 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  45.88 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  45.88 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  45.88 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  45.88 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  44.8 
 
 
262 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  48.33 
 
 
251 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  46.86 
 
 
246 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  45.9 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  49.4 
 
 
261 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  45.04 
 
 
274 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  40.65 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  40.16 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  44.27 
 
 
274 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  43.85 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  42.05 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  43.48 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  42.21 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  41.06 
 
 
265 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  47.77 
 
 
264 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  48.99 
 
 
264 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  50 
 
 
271 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  45.02 
 
 
237 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4246  class II aldolase/adducin family protein  45.53 
 
 
247 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  37.72 
 
 
236 aa  176  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  47.15 
 
 
265 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  38.83 
 
 
250 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>