More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5841 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  81.99 
 
 
262 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  75.58 
 
 
257 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  75.42 
 
 
263 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  66.54 
 
 
263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  64.98 
 
 
263 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  65.35 
 
 
263 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  69.75 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  62.45 
 
 
268 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  63.64 
 
 
262 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  50 
 
 
205 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  50.76 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  42.44 
 
 
254 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  48.1 
 
 
242 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  47.09 
 
 
227 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  46.15 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  49.75 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  39.11 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  41.67 
 
 
249 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  40.38 
 
 
281 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  37.27 
 
 
249 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  40.38 
 
 
282 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  39.9 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  37.2 
 
 
242 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  33.61 
 
 
254 aa  138  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  37.1 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  36.16 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  37.86 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  36.12 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  33.07 
 
 
282 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  35.75 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.39 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  37.89 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  36.24 
 
 
253 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  38.79 
 
 
244 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  34.21 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  38.54 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  39.04 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  35.04 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  36.97 
 
 
257 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  39.57 
 
 
259 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  38.5 
 
 
259 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  37.92 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  34.8 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  33.78 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  34.98 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  37.56 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  35.86 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.65 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  34.76 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  34.75 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.2 
 
 
266 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  34.39 
 
 
256 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  34.19 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  34.19 
 
 
258 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  36.84 
 
 
283 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  35.47 
 
 
243 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  38.3 
 
 
301 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33 
 
 
251 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  34.93 
 
 
257 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  32.91 
 
 
261 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  36.05 
 
 
244 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  36.27 
 
 
331 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  36.27 
 
 
322 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  34.19 
 
 
258 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  34.88 
 
 
267 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  36.1 
 
 
250 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  36.27 
 
 
250 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  37.25 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  35.1 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  33.63 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  34.78 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  40.58 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  31.33 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 
252 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  34.68 
 
 
252 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  30.58 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  34.39 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  34.38 
 
 
241 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  34.27 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  34.74 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  30.04 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  30.17 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  35.19 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  35.29 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  30.17 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  30.17 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  30.17 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  35.61 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  30.37 
 
 
255 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  33.33 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  34.62 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  40.36 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  34.93 
 
 
255 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  33.64 
 
 
246 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  35.35 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34.42 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34.42 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>