More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4466 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  80.53 
 
 		 263 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  77.19 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  77.42 
 
 		 268 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  64.75 
 
 		 263 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  65.45 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  65.35 
 
 		 262 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  64.37 
 
 		 262 aa  347  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  64.98 
 
 		 261 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  65.49 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  48.6 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  42.62 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  44.58 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  46.78 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  48.57 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  44.8 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  45.08 
 
 		 205 aa  185  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  41.22 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  37.97 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  38.06 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  38.93 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  33.58 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  35.06 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  34.38 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  34.38 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  33.98 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  33.86 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  33.21 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  33.98 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  33.98 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.22 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  38.24 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  34.26 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  37.39 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.8 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  34.82 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  34.38 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  34.82 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  38.46 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  36.63 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  33.59 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  34.98 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  38.22 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  35.74 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  34.52 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  35.34 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  37.55 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  36.21 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  32.16 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  33.71 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  32.53 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.8 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  36.19 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.89 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  33.6 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  34.27 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  36.49 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  37.33 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  32.39 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  30.83 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  36.59 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  33.87 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  32.64 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  36.59 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  33.86 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  35.06 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  33.79 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  36.45 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  34.58 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  35.74 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  35.11 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  34.58 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  34.16 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  33.61 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.18 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  32.68 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  34.11 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  32.65 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  37.04 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  36.68 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  32.65 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  32.65 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  31.33 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  31.2 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.51 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  35.74 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  35.74 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  32.81 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  34.09 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  32.56 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  35.48 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  32.52 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  34.11 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>