More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2788 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  62.04 
 
 		 282 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  60.82 
 
 		 277 aa  308  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  61.63 
 
 		 281 aa  305  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  61.22 
 
 		 282 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  60.41 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  59.92 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  61.23 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  59.17 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  57.56 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  55.04 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  56.43 
 
 		 271 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  53.75 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  56.79 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  56.38 
 
 		 281 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  51.64 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  55.97 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  55.97 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  55.97 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  56.02 
 
 		 279 aa  257  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  55.97 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  52.92 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  54.36 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  54.36 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  54.04 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  59.34 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  45.97 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  49.57 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  47.03 
 
 		 268 aa  224  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  50.64 
 
 		 301 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  44.44 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  46.69 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  45.64 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  45.83 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  45.23 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  51.52 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  42.68 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  43.22 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  43.2 
 
 		 276 aa  177  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  42.52 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  43.68 
 
 		 261 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  44.72 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  41.21 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  42 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  41.85 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  42.92 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  42.78 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  40.69 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  37.92 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  43.56 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  42.23 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  46 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  41.29 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  38.79 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  39.2 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  38.28 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  38.28 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  40.78 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  34.91 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  40.38 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  34.63 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  36.73 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  40.19 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  35.65 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  37.04 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  34.44 
 
 		 260 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  36.68 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  34.71 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  35.39 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  40.38 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  42.79 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  40.49 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  39.39 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  38.81 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  40.49 
 
 		 322 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  35.89 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  34.35 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  35.89 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  40 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.73 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  37.11 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  38.05 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  40 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  34.63 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  34.63 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  40 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  39.05 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  38.68 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  38.24 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  34.85 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  34.42 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  34.2 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  38.1 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  36.6 
 
 		 237 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  37.26 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  35.14 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  37.73 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  35.59 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>