More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1979 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  60.82 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  59.92 
 
 		 280 aa  298  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  56.97 
 
 		 259 aa  291  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  57.77 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  55.56 
 
 		 260 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  54.62 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  56.09 
 
 		 281 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  58.02 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  54.62 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  56.09 
 
 		 281 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  56.04 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  59.09 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  54.22 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  57.75 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  57.75 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  57.75 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  52.61 
 
 		 277 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  55.86 
 
 		 279 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  55.86 
 
 		 279 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  55.2 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  49.21 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  55.39 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  50.18 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  52.92 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  48.98 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  45.49 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  57.37 
 
 		 326 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  45.42 
 
 		 268 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  44.57 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  41.4 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  45.8 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  40.87 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  40.22 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  41.18 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  41.67 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  39.27 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  41.8 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  42.8 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  39.48 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  36.84 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  37.13 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  35.96 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  35.02 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  34.14 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  37.13 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35 
 
 		 263 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  37.81 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  36.75 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  36.5 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  36.04 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  36.84 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  37.31 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  35.16 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  36.04 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  33.74 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  34.55 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  36.5 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  32.68 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  35.41 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  39.38 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  32.17 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  36.55 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  34.87 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  38.35 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.64 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  31.47 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  41.33 
 
 		 205 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  31.3 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  36.15 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.11 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  34.85 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  32.27 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  32.37 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  34.15 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  35.41 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  36.1 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  31.62 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  35.12 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  33.92 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  33.81 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  32.41 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  38.32 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  34 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  31.66 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  34.03 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  34.03 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  29.18 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  33.51 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  33.83 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  33.51 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  28.89 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  33.51 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  33.51 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  33.51 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  32.31 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>