More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2655 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  64.04 
 
 		 276 aa  344  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  44.57 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  42.91 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  42.15 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  42.15 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  41 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  41.38 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  39.78 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  40.38 
 
 		 259 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  39.63 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  41.26 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  38.82 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  39.92 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  37.12 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  41.6 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  40.89 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  41.06 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  41.83 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  39.61 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  39.61 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  40.78 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  41.2 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  41.27 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  41.27 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  41.27 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  42.68 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  43.59 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  37.2 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  35.18 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  37.04 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 		 301 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  34.8 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  33.07 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  30.56 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  31.37 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  31.4 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  27.94 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  28.24 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  27.31 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  29.66 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  29.82 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  31.22 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  31.94 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  28.81 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  30.77 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  25.97 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  32.85 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  32.85 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  32.85 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  29.33 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  27.36 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  30.64 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  27.19 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  27.19 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  27.98 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  25.71 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  28.7 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  30.65 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  26.94 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  32.04 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  31.61 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  24.9 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  24.49 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  26.87 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  30.89 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  29.91 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  27.75 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  30.05 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  25.62 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.73 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  29.91 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  28.57 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  28.04 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  28.04 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  26.83 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  25.2 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  27.27 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  28.46 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  26.77 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  29.9 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  29.73 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  29.73 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  29.25 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  29.91 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  29.08 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  28.96 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  30.58 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  29.76 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  28.45 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  27.27 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  28.45 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  28.51 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  28.15 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  27.88 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  26.94 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>