More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5988 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  60.08 
 
 
268 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  62 
 
 
263 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  56.68 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  55.35 
 
 
282 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  58.89 
 
 
277 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  58.5 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  54.41 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  54.62 
 
 
260 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  52.42 
 
 
301 aa  270  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  49.21 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  48.86 
 
 
268 aa  262  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  51.59 
 
 
280 aa  258  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  49.19 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  52.5 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  48.62 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  55.04 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  50.61 
 
 
259 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  49.81 
 
 
281 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  49.42 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  49.42 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  49.42 
 
 
279 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  51.65 
 
 
301 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  49.42 
 
 
279 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  49.42 
 
 
279 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  44.09 
 
 
279 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  47.86 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  45.91 
 
 
279 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  45.91 
 
 
279 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  47.5 
 
 
271 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  47.22 
 
 
274 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  42.32 
 
 
286 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  42.7 
 
 
298 aa  224  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  43.25 
 
 
287 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  51.33 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  51.32 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  39.78 
 
 
274 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  42.17 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  40.16 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  38.86 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  40.1 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  38.97 
 
 
256 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.89 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  38.89 
 
 
256 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  38.89 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  39.6 
 
 
262 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  39.15 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  32.76 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  40.86 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  38 
 
 
263 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  38.42 
 
 
251 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  37.75 
 
 
246 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  35.68 
 
 
257 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  38.54 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  40.87 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  34.93 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  38.86 
 
 
251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 
259 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  36.73 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  36.63 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  37.77 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  37.68 
 
 
264 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  37.77 
 
 
260 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  36.64 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  33.73 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  36.59 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  38.78 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  38.12 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  37.83 
 
 
260 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  39.39 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  34.92 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  37.36 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  37.39 
 
 
260 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  36.51 
 
 
264 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.12 
 
 
258 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  35.94 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  36.73 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  33.19 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  36.36 
 
 
257 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  35.48 
 
 
263 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  37.97 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  36.56 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  37.69 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  36.55 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.48 
 
 
251 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  36 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  35.05 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  36.87 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  30.8 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  34.03 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  37.11 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  33.49 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  116  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.19 
 
 
263 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  34.02 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  31.22 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.57 
 
 
259 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 
266 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  32.88 
 
 
263 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>