More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1848 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  89.72 
 
 		 282 aa  517  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  91.46 
 
 		 281 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  89.01 
 
 		 282 aa  510  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  89.18 
 
 		 268 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  64.29 
 
 		 253 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  58.89 
 
 		 271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  58.94 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  62.25 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  60.82 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  55.21 
 
 		 280 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  53.6 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  54.48 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  52 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  52.61 
 
 		 283 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  56.79 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  55.79 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  51.43 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  56.05 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  55.65 
 
 		 281 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  55.24 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  55.24 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  55.24 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  54.88 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  54.88 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  51.1 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  49.41 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  55.7 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  48.62 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  48.03 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  49.8 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  47.45 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  47.24 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  45.67 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  55.85 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  47.56 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  45 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  41 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  42.23 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  40.85 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  35.38 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  39.09 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  37.07 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  35.27 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  34.39 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  35.59 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  37.7 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  43.09 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  38.6 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  38.6 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  34.76 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  34.69 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.01 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  36.43 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  32.53 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  34.68 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  34.35 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  36.16 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  33.87 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  35.78 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  37.86 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  34.2 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  36.95 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  37.24 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  35.78 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  36.6 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  34.75 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  40.82 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  34.17 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  33.19 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  38.16 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  37.31 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  35.71 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  35.85 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  36.08 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  39.11 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  34.76 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  34.14 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  34.9 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  34.78 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  33.61 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.96 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  34.58 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  37.88 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.32 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  33.73 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  33.73 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  35.55 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  34.89 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  34.98 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.38 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  32.89 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  36.24 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  32.17 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  30.28 
 
 		 256 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  35.44 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>