More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3870 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  77.7 
 
 		 279 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  77.7 
 
 		 279 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  76.07 
 
 		 281 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  75.71 
 
 		 281 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  75.9 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  72.31 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  68.52 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  60.98 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  59.5 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  58.02 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  51.6 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  51.25 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  54.37 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  52 
 
 		 277 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  53.48 
 
 		 280 aa  288  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  55.16 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  55.04 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  52.73 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  54.04 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  47.22 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  49.06 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  59.16 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  45.93 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  44.49 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  43.5 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  40.14 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  44.08 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  41.2 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  38.52 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  43.53 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  37.2 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  38.8 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  36.21 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  35.93 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  36.51 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  33.64 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  36.21 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  37.02 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 		 205 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  39.15 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  34.73 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  37.17 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  35.19 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  32.87 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  32.71 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.24 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  34.56 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  35.81 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  34.5 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  33.2 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  36.11 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  31.02 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  36.62 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  32.89 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  35.21 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  31.48 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.05 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  36.2 
 
 		 262 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  33.97 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  34.13 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  34.26 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  36.45 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  34.86 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  32.37 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  33.91 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  34.93 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  34.78 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  34.78 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  35.19 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  34.78 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  34.93 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.58 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  36.71 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  33.98 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  33.63 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  30.87 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  35.52 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  31.33 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  30.24 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  34.87 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  32.88 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  32.88 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  36.41 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  32.42 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  34.22 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  30.9 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  34.91 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  32.86 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  36.1 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>