More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0980 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  45.64 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  44.72 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  46.81 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  42.62 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  44.59 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  44.12 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  41.94 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  43.72 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  42.44 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  41.56 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  42.74 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  47.85 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  47.37 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  40.66 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  45.93 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  46.01 
 
 		 227 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  45.31 
 
 		 205 aa  162  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  42.25 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  37.7 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  38.03 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  38.22 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  38.17 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  36.22 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  36.11 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  35.8 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  35.84 
 
 		 242 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  36.97 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.96 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.37 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  36.94 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.55 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  34 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  34.84 
 
 		 261 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  36.21 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.91 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  34 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  35.62 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  34.21 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.72 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  34.78 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  36.86 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  37.34 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  34.45 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  36.33 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  35.39 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  34.53 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  34.98 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  36.61 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  36.61 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  35.74 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  36.11 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  35.05 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  36.51 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  40 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  36.6 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  35.14 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34.14 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34.14 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  34.55 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  31.76 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  31.15 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  32.54 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  35.78 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  37.21 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  32.35 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  31 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  36.23 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  29.8 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  33.49 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  35.55 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  35.35 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  33.81 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  34.57 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  35.55 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  32.62 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  32.38 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  32.05 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  35.94 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  31.52 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  34.04 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  32.26 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  33.64 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  36.82 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  33.18 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  33.19 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>