273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3692 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  72.73 
 
 		 246 aa  310  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  69.81 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  66.67 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  63.85 
 
 		 246 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  48.61 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  44.8 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  46.64 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  45.12 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  48.51 
 
 		 263 aa  181  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  47.09 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  46.8 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  43.26 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  48.88 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  47.2 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  41.51 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  46.01 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  38.5 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  41.67 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  39.82 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  40.38 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  34.1 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  34.72 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  35.98 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  34.11 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  34.96 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.7 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  32.74 
 
 		 252 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.37 
 
 		 251 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  35.48 
 
 		 256 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  32.3 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 259 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  37.7 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  34.8 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  32.44 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  31.84 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  34.33 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  34.17 
 
 		 282 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  31.96 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 256 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  32.37 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  34.69 
 
 		 271 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  31.37 
 
 		 251 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  37.16 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  33.16 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  31.96 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  30.1 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  30.46 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  34.17 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  30.43 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  31.68 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  31.13 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  31.22 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  31.88 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  36.67 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  32.81 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  32.31 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  32.31 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  32.18 
 
 		 282 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  32.31 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  31.13 
 
 		 281 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  31.61 
 
 		 277 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  30.66 
 
 		 282 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  31.63 
 
 		 256 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  33.01 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  32.79 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  32.56 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  29.8 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  33.5 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  32.04 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  31.43 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  31.91 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  30.73 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  31.28 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  30.46 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  32.16 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  31.94 
 
 		 277 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  32.97 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  29.2 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  29.35 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  32.97 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  32.97 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  29.81 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  31.5 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  32.97 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  27.98 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  33 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  32.97 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  30 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  27.98 
 
 		 257 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  32.97 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>