More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2007 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  50.87 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  48.02 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  47.66 
 
 		 249 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  45.87 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  42.08 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  46.84 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  37.93 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  39.52 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  37.1 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  37.2 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  37.71 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  37.38 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  36.19 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  35.62 
 
 		 262 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  35.47 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  39.09 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  35.84 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  37.11 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  36.62 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  34.1 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  33.02 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  34.76 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  35.55 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  31.82 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  30.88 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  32.72 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3790  hypothetical protein  45.9 
 
 		 147 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.952692  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  31.84 
 
 		 257 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  31.84 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  31.84 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  32.29 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  32.26 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  32.56 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2702  class II aldolase/adducin family protein  31.63 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00187501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  29.49 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  30.05 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  31.34 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  31.72 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  28.87 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  30.73 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  31.36 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  28 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  30.85 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  31.22 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  30.35 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  30.35 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  29.3 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  30.35 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  30 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  31.28 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  31.28 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  31.46 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  30.52 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  29.63 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  31.43 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  28.5 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  32.18 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  28.44 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  30.04 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  31.66 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  30.41 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  29.86 
 
 		 265 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  29.15 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  29.15 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  31.38 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  31.36 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  30.65 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  29.6 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  30.52 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  28.64 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  30.66 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  30.99 
 
 		 274 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  31.66 
 
 		 259 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  27.91 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  32.82 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  31.8 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  29.35 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  27.94 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  31.5 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  29.52 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  30.99 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  29.96 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  29.03 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  29.11 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  29.96 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  32.24 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  26.64 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  31.96 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  32.24 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  26.85 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  28.7 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  31.65 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  30.94 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  28.75 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  27.27 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  29.25 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>