158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3790 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3790  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.952692  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  79.85 
 
 		 249 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  62.41 
 
 		 249 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  56.3 
 
 		 244 aa  155  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  45.9 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  43.28 
 
 		 241 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  40.8 
 
 		 263 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  41.46 
 
 		 268 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  38.24 
 
 		 247 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  39.84 
 
 		 263 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  38.06 
 
 		 254 aa  95.9  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  43.44 
 
 		 263 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  38.84 
 
 		 263 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  37.29 
 
 		 263 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  42.71 
 
 		 246 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  36.29 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  37.61 
 
 		 256 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  39.6 
 
 		 262 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  39.8 
 
 		 246 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  30.88 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  44.21 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  37.62 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  34.65 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  36.72 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  41.46 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  30.3 
 
 		 259 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  32.8 
 
 		 257 aa  70.5  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  40 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  37.21 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  37.32 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  32.56 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  30.99 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  31.65 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  38 
 
 		 251 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  33.86 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  31.82 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  36.84 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  30.28 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  32.82 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  33.03 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  29.5 
 
 		 267 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  34.04 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  32.33 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  33.64 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  31.45 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  32.81 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  32.79 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  34.38 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  30.53 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  32.79 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  31.91 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  32.79 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  32.26 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  30.37 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  29.63 
 
 		 250 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  29.27 
 
 		 262 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  32.79 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  31.97 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  34.68 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  28.66 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  26.95 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  31.97 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  28.57 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  28.97 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  31.97 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  30.67 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  29.2 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  29.2 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  31.43 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  26.51 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  26.96 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  30.67 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  33.07 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  31.06 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  31.25 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  29.84 
 
 		 250 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  33.67 
 
 		 259 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  29.23 
 
 		 282 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  28.05 
 
 		 262 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  34.68 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  28.24 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  32.48 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  27.74 
 
 		 258 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  37.5 
 
 		 256 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  28.47 
 
 		 258 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  27.74 
 
 		 257 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34.83 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34.83 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  32.03 
 
 		 261 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  31.71 
 
 		 280 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  32.81 
 
 		 261 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  34.83 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  34.15 
 
 		 256 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>