287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2702 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2702  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
244 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00187501  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  72.31 
 
 
250 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  61.86 
 
 
250 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  59.24 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  47.03 
 
 
265 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  46.64 
 
 
263 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  46.64 
 
 
263 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  43.98 
 
 
260 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  45.85 
 
 
257 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  45.85 
 
 
257 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  45.85 
 
 
257 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  45.41 
 
 
257 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  45.41 
 
 
257 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  45.41 
 
 
257 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  45.41 
 
 
257 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  43.93 
 
 
277 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  45.85 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  41.45 
 
 
256 aa  194  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  45.69 
 
 
258 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  45.69 
 
 
258 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  45.41 
 
 
258 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  41.84 
 
 
274 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  45.26 
 
 
258 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  45.26 
 
 
258 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  45.26 
 
 
258 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  45.26 
 
 
258 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  41.42 
 
 
274 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  39.75 
 
 
264 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  40.69 
 
 
251 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  35.19 
 
 
255 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  36.86 
 
 
256 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 
264 aa  175  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  40.67 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  38.24 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  37.97 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  35.02 
 
 
250 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  34.76 
 
 
257 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  41.12 
 
 
251 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  39.91 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  40.5 
 
 
251 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  39.91 
 
 
258 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.62 
 
 
258 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  37.29 
 
 
250 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  39.91 
 
 
252 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  37.29 
 
 
331 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  37.29 
 
 
322 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  39.56 
 
 
252 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  36.75 
 
 
254 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  39.06 
 
 
258 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  40.47 
 
 
263 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  36.13 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  40.39 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  39.23 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  39.71 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  38.89 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.97 
 
 
282 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  39.15 
 
 
259 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  38.5 
 
 
259 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  34.76 
 
 
256 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  36.6 
 
 
255 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  36.6 
 
 
255 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  34.57 
 
 
259 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  35.39 
 
 
256 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  35.59 
 
 
261 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  39.23 
 
 
255 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  39.23 
 
 
255 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  34.31 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  35.17 
 
 
260 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  40.98 
 
 
257 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  34.16 
 
 
259 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.33 
 
 
266 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  34.02 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.07 
 
 
257 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  35.96 
 
 
237 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  38.63 
 
 
257 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  38.63 
 
 
257 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  38.12 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  34.57 
 
 
261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  36.76 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  38.1 
 
 
255 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  38.63 
 
 
258 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  38.1 
 
 
255 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
251 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  41.34 
 
 
264 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  38.1 
 
 
257 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  32.64 
 
 
256 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  33.95 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  40.11 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  38.14 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  36.08 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  37.57 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  38.62 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  35.57 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
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NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  35.57 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  36.79 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  33.01 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  33.97 
 
 
262 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
262 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  31.06 
 
 
271 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
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