More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0795 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  567  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  70.61 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  52.17 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  48.94 
 
 		 282 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  49.29 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  50.59 
 
 		 281 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  51.2 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  49.19 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  49.41 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  51.17 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  50.79 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  52.32 
 
 		 260 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  48.98 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  46.43 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  52.26 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  48.45 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  46.4 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  44.4 
 
 		 280 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  50.64 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  49.79 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  44.35 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  49.37 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  49.01 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  49.01 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  49.01 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  49.41 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  48.02 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  48.62 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  48.62 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  45.93 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  46.91 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  46.91 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  43.51 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  42.68 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  50.52 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  43.72 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  38.82 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  40.08 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  31.54 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  39.44 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  41.29 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.14 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  38.16 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  38.74 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  39.78 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  37.86 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  37.27 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  31.63 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  34.68 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  35.75 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  37.77 
 
 		 257 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  36.32 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  36.84 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  33.48 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.96 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.96 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  33.88 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  42 
 
 		 205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  31.54 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  35.81 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  30.09 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  37.07 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  35.71 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.19 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  34.33 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  34.33 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  35.08 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  30.49 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  35.15 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  32.87 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  35.78 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  32.21 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  32.21 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  31.63 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  34.7 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  29.78 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  32.21 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  32.18 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  34.83 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  35.9 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  35.9 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  34.78 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  32.21 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  33.68 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  31.85 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  35.12 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  38.46 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  33.18 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  35.79 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  30.99 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  33.16 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  31.88 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.98 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  32 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  31.88 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>