More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0283 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  308  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  55 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  55.21 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  58.33 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  57.92 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  58.33 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  54.23 
 
 
260 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  54.23 
 
 
260 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  56.67 
 
 
260 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  56.67 
 
 
260 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  56.67 
 
 
260 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  55.56 
 
 
259 aa  292  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  55.6 
 
 
260 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  52.12 
 
 
260 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  52.12 
 
 
260 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  52.12 
 
 
260 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  55.21 
 
 
261 aa  285  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  51.72 
 
 
262 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  52.17 
 
 
258 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  48.21 
 
 
258 aa  255  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  33.48 
 
 
259 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  32.77 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  32.77 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  34.63 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  32.77 
 
 
282 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  32.17 
 
 
253 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  31.3 
 
 
260 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  31.49 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  31.49 
 
 
281 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  28.44 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  31.7 
 
 
263 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  32.03 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  29.78 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  31.68 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  31.3 
 
 
283 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  30.47 
 
 
274 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  32.64 
 
 
281 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  32.35 
 
 
279 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  34.03 
 
 
298 aa  105  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  32.22 
 
 
281 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  31.63 
 
 
301 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  30.54 
 
 
280 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  30.92 
 
 
271 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  31.51 
 
 
279 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  31.51 
 
 
279 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  31.51 
 
 
279 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  32.83 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  30.25 
 
 
279 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  30.56 
 
 
279 aa  99  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  29.78 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  36.26 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  29.75 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  33.17 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  29.83 
 
 
279 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  29.83 
 
 
279 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  32.16 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  30.45 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  33.16 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  29.36 
 
 
287 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  27.06 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  30.8 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  29.56 
 
 
312 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.85 
 
 
215 aa  88.6  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.43 
 
 
214 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  35.37 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.13 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  34.57 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  27.66 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  28.35 
 
 
205 aa  85.9  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  32.57 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  28.51 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  25.56 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  28.75 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  29.66 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  27.06 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  30.26 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  29.66 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  32.54 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  29.41 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  29.66 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  29.05 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  28.81 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  29.55 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  27.35 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  30.51 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  27.83 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  29.94 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  26.04 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  30.37 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  28.84 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  27.5 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  32.1 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>