More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1648 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  47.09 
 
 
242 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  32.77 
 
 
260 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  32.77 
 
 
260 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  32.47 
 
 
259 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  32.34 
 
 
260 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  33.93 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  32.71 
 
 
258 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  31.06 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  33.05 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  32.62 
 
 
260 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  31.8 
 
 
260 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  31.06 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  30.96 
 
 
260 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  31.86 
 
 
260 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  31.86 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  31.47 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  31.47 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  33.98 
 
 
253 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  31.06 
 
 
260 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  29.39 
 
 
259 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  30.6 
 
 
260 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  29.82 
 
 
258 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  32.33 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  32.33 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  32.33 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  32.33 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  29.13 
 
 
271 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  30.74 
 
 
261 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  32.11 
 
 
260 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  33.95 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  32.29 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  31.39 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 
271 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  34.47 
 
 
271 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  31 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  29.78 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  28.64 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  34.05 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  30.34 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  32.84 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  30.29 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  30.23 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  30.84 
 
 
258 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  30.5 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  26.4 
 
 
236 aa  93.2  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  30.64 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  32.11 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  30.52 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  30.17 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  30.4 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  30.26 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  30.26 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  30.26 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  29.15 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  27.76 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  30.27 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  29.82 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  27.67 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  30.27 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  30.43 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  30.19 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  29.84 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  27.71 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  28 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  28.14 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  30 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  29.61 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  29.15 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  27.14 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  28.11 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  28.38 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  30.15 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  28.14 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  25.11 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  26.92 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  27.04 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  28.11 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  29.65 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  27.59 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  26.34 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  30.14 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  32.02 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  29.25 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  27.47 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  29.65 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  27.35 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  25.41 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  30.81 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  30 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  30 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  30 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  31.07 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  23.93 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  28.1 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  29.18 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  25.51 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  28.51 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>