More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0035 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  46.73 
 
 
214 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  46.01 
 
 
213 aa  197  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  41.23 
 
 
229 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  42.36 
 
 
215 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  42.79 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  40.28 
 
 
219 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  40 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  41.86 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  42.52 
 
 
212 aa  177  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  40.3 
 
 
223 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  39.3 
 
 
242 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  37.85 
 
 
222 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  40.19 
 
 
217 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  42.06 
 
 
212 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.21 
 
 
238 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  40.65 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  39.72 
 
 
237 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  38.21 
 
 
220 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  40 
 
 
214 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  38.31 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  39.25 
 
 
213 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3273  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.94 
 
 
236 aa  164  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0199942 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.42 
 
 
230 aa  164  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  38.14 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  38.32 
 
 
213 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.07 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2754  class II aldolase/adducin family protein  37.02 
 
 
237 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172174  decreased coverage  0.00000252698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.57 
 
 
223 aa  161  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 
213 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  37.38 
 
 
213 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 
213 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 
213 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 
213 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 
213 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0380  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.56 
 
 
231 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  41.26 
 
 
213 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  37.38 
 
 
213 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  37.74 
 
 
222 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  35.41 
 
 
222 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  39.44 
 
 
212 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  40.3 
 
 
226 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  37.07 
 
 
215 aa  154  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3928  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  43.72 
 
 
240 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000124129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  41.87 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  41.54 
 
 
228 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  37 
 
 
212 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 
212 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29510  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.67 
 
 
243 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  34.98 
 
 
215 aa  147  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4728  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  39.7 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1810  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.93 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00111407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.53 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3262  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  40.39 
 
 
231 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3395  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  40.39 
 
 
231 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0923  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  40.39 
 
 
231 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4806  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.69 
 
 
228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.69 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.69 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.69 
 
 
228 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.69 
 
 
228 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04065  L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase  38.19 
 
 
228 aa  141  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04027  hypothetical protein  38.19 
 
 
228 aa  141  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  36.71 
 
 
212 aa  141  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3795  class II aldolase/adducin family protein  38.19 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.114454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3815  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.19 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0563678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3467  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.93 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.443237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0127  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.52 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2898  class II aldolase/adducin family protein  39.59 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.38221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  35.2 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1978  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.69 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000786518  normal  0.0917284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3787  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.52 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0131  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.52 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4656  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.69 
 
 
228 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  38.54 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1996  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.58 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000658884  unclonable  0.0000198726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2065  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.58 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000152307  hitchhiker  0.00000244495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0773  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  40.89 
 
 
231 aa  138  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03435  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.52 
 
 
231 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03386  hypothetical protein  36.52 
 
 
231 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4080  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.52 
 
 
231 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1992  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  41 
 
 
242 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00598433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1706  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  39.59 
 
 
231 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0268969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3906  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.89 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.936688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3955  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.03 
 
 
231 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.918987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.79 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3891  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.03 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0325  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.63 
 
 
232 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1739  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.41 
 
 
231 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.53 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4000  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.03 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.850049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4062  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.03 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.612579 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0330  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.89 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2139  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.56 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  normal  0.896628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00062  hypothetical protein  35.53 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0985  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.45 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.53 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3875  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.91 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2067  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.87 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000421715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>