270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4246 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4246  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  45.05 
 
 
261 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  43.1 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  45.5 
 
 
261 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  42.86 
 
 
256 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  41.43 
 
 
257 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  44.49 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  44.49 
 
 
258 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  42.62 
 
 
259 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  41.25 
 
 
256 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  42.21 
 
 
257 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  42.4 
 
 
257 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  39.67 
 
 
256 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  44.07 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  40.49 
 
 
282 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  40.23 
 
 
262 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  43.64 
 
 
257 aa  165  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  38.49 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  43.09 
 
 
259 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  41.91 
 
 
263 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  40.66 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  46.08 
 
 
258 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  41.32 
 
 
266 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  40.24 
 
 
252 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  39 
 
 
250 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  42.79 
 
 
261 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  40.42 
 
 
255 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  40.5 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  39.58 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  39.18 
 
 
262 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  43.64 
 
 
257 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  43.64 
 
 
257 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  42.08 
 
 
237 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  39.17 
 
 
255 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  39.17 
 
 
255 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  37.96 
 
 
262 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  38.8 
 
 
252 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  40.41 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  37.96 
 
 
259 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  37.96 
 
 
259 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  43.72 
 
 
251 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  43.22 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  39.43 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  41.32 
 
 
257 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  41.32 
 
 
257 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  41.32 
 
 
257 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  40.5 
 
 
255 aa  148  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 
258 aa  148  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  39.83 
 
 
250 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  39.41 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  39.92 
 
 
267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  39.41 
 
 
322 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  34.3 
 
 
255 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  41.87 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  38.82 
 
 
331 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  43.58 
 
 
257 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  38.55 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  37.8 
 
 
260 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  41.13 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  37.6 
 
 
259 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  40.5 
 
 
257 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  40.5 
 
 
257 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  39.11 
 
 
251 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  39.33 
 
 
261 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  40.5 
 
 
257 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  38.17 
 
 
255 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  40.65 
 
 
263 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  40.08 
 
 
257 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  39.91 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  38.65 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  40.27 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  38.31 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  39.46 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  36.58 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  39.46 
 
 
271 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  36.58 
 
 
256 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  39.67 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  39.67 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  39.67 
 
 
258 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  37.19 
 
 
251 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  37.34 
 
 
254 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  39.26 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  39.26 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  39.26 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  36.03 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  39.26 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  37.75 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  42.28 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  37.65 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  37.05 
 
 
274 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
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NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  34.71 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
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NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  34.57 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  34.71 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  39.73 
 
 
265 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 
254 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
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NC_002978  WD0208  hypothetical protein  31.4 
 
 
236 aa  122  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  42.55 
 
 
250 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  35.1 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
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