More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2485 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
226 aa  440  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  71.88 
 
 
204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  70 
 
 
208 aa  264  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  69.5 
 
 
208 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  57.28 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  51.22 
 
 
219 aa  208  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  52.55 
 
 
220 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  54.15 
 
 
220 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  48.67 
 
 
231 aa  197  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  48.62 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  53.73 
 
 
211 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  51.22 
 
 
210 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  51.22 
 
 
224 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  49.51 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  47.78 
 
 
210 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  47.29 
 
 
210 aa  189  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  50.75 
 
 
220 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  46.38 
 
 
210 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  49.51 
 
 
226 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  52.22 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  49.02 
 
 
220 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  48.53 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  49.01 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  49.5 
 
 
224 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  50.98 
 
 
221 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  46.67 
 
 
218 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  48.28 
 
 
212 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  48.28 
 
 
212 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  48.28 
 
 
212 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  48.28 
 
 
212 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  48.28 
 
 
212 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  46.19 
 
 
218 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  49.5 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  48.02 
 
 
216 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  46.31 
 
 
212 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  47.09 
 
 
210 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  45.41 
 
 
212 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  43.62 
 
 
217 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  52.43 
 
 
209 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  42.5 
 
 
218 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  42.7 
 
 
212 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  43.5 
 
 
216 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  42.7 
 
 
212 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  47.73 
 
 
220 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  43.09 
 
 
214 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  41.33 
 
 
213 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  41.54 
 
 
212 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  42.25 
 
 
212 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  40.5 
 
 
220 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  43.32 
 
 
214 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  41.03 
 
 
220 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  42.05 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  42.13 
 
 
212 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  42.13 
 
 
212 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  42.13 
 
 
212 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  42.16 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  42.23 
 
 
222 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  41.84 
 
 
212 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  41.62 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  41.62 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  41.62 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  41.62 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  41.62 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  41.08 
 
 
213 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  40.48 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  39.9 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  38.8 
 
 
207 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  38.92 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  37.3 
 
 
218 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  38.04 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  35 
 
 
215 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  37.7 
 
 
220 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.13 
 
 
222 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.57 
 
 
220 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  34.39 
 
 
225 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  29.78 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  33.7 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  28.65 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  34.97 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
181 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  36.67 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  35.21 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  32.63 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  32.42 
 
 
238 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>