261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0444 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  81.7 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  78.85 
 
 		 222 aa  352  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  56.44 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  56.19 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  53.74 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  51.56 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  52.89 
 
 		 220 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  50.86 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  53.54 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  52 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  52 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  52 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  52.23 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  50.67 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  50.45 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  50.22 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  51.77 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  50.22 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  51.77 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  52.44 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  44.25 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  45.98 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  45.54 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  44.2 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  44.84 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  44.2 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.88 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  42.6 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  48.66 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  46.88 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  43.5 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  42.29 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  39.37 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  40.4 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  39.9 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  39.65 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  37.78 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  38.29 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  37.78 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  39.73 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  39.29 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  38.18 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  42.21 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  36.94 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  36.82 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  38.01 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  38.46 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  38.46 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  38.46 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  38.46 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  39.9 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  38.01 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  37.74 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  38.12 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  38.29 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  35.53 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  61.82 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  38.33 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  31.6 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  29.65 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  30.52 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  27.19 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  31.75 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.31 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  25.11 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  32.85 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  28.64 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  27.96 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  27.83 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  31.65 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.46 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  27.56 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  26.94 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  31.08 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  28.7 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  29.9 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  25.4 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  26.56 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  26.9 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  30.81 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.7 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  25.81 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  33.55 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>