More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3210 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  96.23 
 
 
212 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  92.92 
 
 
212 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  93.4 
 
 
213 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  93.87 
 
 
213 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  87.56 
 
 
213 aa  349  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  79.62 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  79.15 
 
 
220 aa  347  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  79.15 
 
 
220 aa  348  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  86.12 
 
 
213 aa  346  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  86.6 
 
 
213 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  86.6 
 
 
213 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  86.6 
 
 
213 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  86.6 
 
 
213 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  86.6 
 
 
213 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  79.15 
 
 
214 aa  332  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  78.67 
 
 
214 aa  330  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  74.53 
 
 
212 aa  311  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  70.51 
 
 
217 aa  310  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  73.11 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  73.58 
 
 
212 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  73.11 
 
 
212 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  54.02 
 
 
224 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  54.3 
 
 
222 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  52 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  48.82 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  47.62 
 
 
220 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  47.39 
 
 
219 aa  187  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  49.29 
 
 
224 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  48.57 
 
 
220 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  48.82 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  47.6 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  48.57 
 
 
225 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  46.67 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  45.89 
 
 
210 aa  178  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  45.97 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  47.6 
 
 
211 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  45.41 
 
 
224 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  42.03 
 
 
243 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.63 
 
 
221 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  42.03 
 
 
231 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  47.15 
 
 
217 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  46.15 
 
 
218 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  44.55 
 
 
212 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  42.99 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  40.69 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  42.23 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  41.67 
 
 
210 aa  161  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  42.51 
 
 
210 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  42.33 
 
 
218 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  40 
 
 
210 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  43.48 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  43.48 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  43.48 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  43.48 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  43 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  42.13 
 
 
226 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  37.25 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  39.42 
 
 
208 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  39.61 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  45.12 
 
 
209 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  36.59 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  34.11 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  35.03 
 
 
204 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  27.98 
 
 
264 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.22 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.13 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  30.94 
 
 
265 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  29.47 
 
 
303 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  35 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  32.43 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30.77 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  31.07 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  34.62 
 
 
217 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
398 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  32.72 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  30.46 
 
 
181 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  36.15 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.62 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  32.14 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  46.23 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  29 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  30.11 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.53 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  32.08 
 
 
427 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  28.27 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  31.28 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  31.31 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  26.51 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  29.3 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>