208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4877 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  81.7 
 
 
224 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  76.99 
 
 
222 aa  345  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  57.14 
 
 
214 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  56.44 
 
 
214 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  53.33 
 
 
212 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  53.33 
 
 
220 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  52.44 
 
 
218 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  53.57 
 
 
220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  49.78 
 
 
217 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  52.68 
 
 
213 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  54.02 
 
 
212 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  53.57 
 
 
212 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  54.02 
 
 
212 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  54.02 
 
 
212 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  51.79 
 
 
212 aa  214  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  51.79 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  52.23 
 
 
213 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  52.23 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  52.23 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  51.56 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  52.23 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  52.23 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  52.23 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  54.46 
 
 
212 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  51.33 
 
 
212 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  51.33 
 
 
212 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  46.43 
 
 
220 aa  184  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  45.98 
 
 
222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  45.09 
 
 
224 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  45.54 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  44.39 
 
 
225 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  47.32 
 
 
211 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  45.54 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  43.75 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  46.19 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  45.54 
 
 
218 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  44.14 
 
 
226 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  42.34 
 
 
220 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  43.17 
 
 
219 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  42.86 
 
 
224 aa  154  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  42.86 
 
 
210 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  40.18 
 
 
243 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  40.18 
 
 
231 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  45.05 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  40.7 
 
 
218 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  38.67 
 
 
216 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  40.2 
 
 
218 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  40.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  40.72 
 
 
210 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  37.27 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  40.48 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  37.27 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  39.37 
 
 
212 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  39.37 
 
 
212 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  39.37 
 
 
212 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  39.37 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  38.91 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  36.36 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  37.84 
 
 
210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  40.09 
 
 
204 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  38.99 
 
 
208 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  39.17 
 
 
208 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  40.56 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  62.83 
 
 
297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  34.53 
 
 
216 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  29.26 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  33.18 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.19 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.05 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  27.27 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.1 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  33.56 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  31.6 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  30.69 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  28.3 
 
 
398 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  28.64 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  30.73 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  30.69 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  28.64 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  27.19 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  30.16 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.54 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  29.37 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.78 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  27.41 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  26.26 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  27.68 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  26.42 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  31.63 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  27.56 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  30.8 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  28.95 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  28.67 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>