More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3143 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  62.32 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  61.84 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  53.4 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  51.94 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  52.43 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  54.33 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  51.94 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  52.91 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  51.21 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  53.11 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  51.71 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  51.69 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  51.22 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  51.94 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  50 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  50.49 
 
 		 243 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  54.9 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  50.49 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  53.14 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  51.67 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  49.51 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  51.21 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  50.24 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  48.29 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  48.29 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  48.29 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  50.25 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  48.29 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  47.06 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  47.8 
 
 		 212 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  47.5 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  47 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  51.22 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  50.73 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  52.43 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  47.74 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  44.56 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  43.52 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  45.92 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  45.13 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  44.56 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  44.56 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  42.86 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  42.33 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  45.13 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  43.01 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  43.88 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  44.56 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  44.56 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  44.04 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  44.56 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  43.88 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  42.71 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  45.64 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  45.64 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  45.64 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  45.64 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  45.64 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  45.64 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  45.13 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  40.91 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  40.7 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  42.29 
 
 		 222 aa  127  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  40.2 
 
 		 224 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  38.01 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  35.27 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  31.58 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  31.13 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  35.24 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  33.82 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  30.62 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.83 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  30.96 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  33.65 
 
 		 427 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  31.38 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  30.27 
 
 		 180 aa  84.7  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30.1 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 265 aa  84.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.35 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  29.25 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  35.33 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  32.45 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  27.67 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>