More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5062 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  97.64 
 
 
212 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  76.19 
 
 
220 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  75.71 
 
 
220 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  75.6 
 
 
218 aa  327  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  73.81 
 
 
214 aa  322  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  73.58 
 
 
212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  73.11 
 
 
212 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  71.43 
 
 
217 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  72.73 
 
 
214 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  73.58 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  71.7 
 
 
213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  74.64 
 
 
213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  73.11 
 
 
213 aa  304  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  73.58 
 
 
212 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  73.58 
 
 
212 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  73.58 
 
 
212 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  74.64 
 
 
213 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  74.16 
 
 
213 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  74.16 
 
 
213 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  74.16 
 
 
213 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  74.16 
 
 
213 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  74.16 
 
 
213 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  66.04 
 
 
212 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  54.71 
 
 
222 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  51.77 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  51.33 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  47.64 
 
 
219 aa  198  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  47.87 
 
 
226 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  47.62 
 
 
211 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  46.67 
 
 
221 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  48.04 
 
 
222 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  45.41 
 
 
220 aa  184  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  47.8 
 
 
224 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  46.19 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  45.24 
 
 
228 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  45.93 
 
 
225 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  45.71 
 
 
220 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  45.28 
 
 
220 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  44.23 
 
 
220 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  42.99 
 
 
216 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  43.68 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  43.55 
 
 
218 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  43.14 
 
 
212 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  41.15 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  40.41 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  42.27 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  38.21 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  38.21 
 
 
231 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  40.67 
 
 
224 aa  161  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  43.22 
 
 
217 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  39.58 
 
 
210 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  43.23 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  36.23 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  43.23 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  43.23 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  43.23 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  42.71 
 
 
212 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  41.84 
 
 
226 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  40.1 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  40.1 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  40.11 
 
 
210 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  38.05 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  41.62 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  36.04 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  36.81 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.77 
 
 
264 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 
265 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  29.91 
 
 
214 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.64 
 
 
225 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  31.05 
 
 
303 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.9 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
215 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  31.89 
 
 
398 aa  97.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  32.69 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  31.28 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  33.98 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  31.68 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
180 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  33.82 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  32.8 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.93 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  31.09 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  29.57 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  46.23 
 
 
297 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 
180 aa  88.2  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.64 
 
 
181 aa  88.2  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  32.54 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  36.69 
 
 
332 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
428 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  32.77 
 
 
190 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  34.09 
 
 
324 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  27.57 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>