More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1632 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  59.91 
 
 
219 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  57.82 
 
 
220 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  56.4 
 
 
222 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  58.45 
 
 
220 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  56.4 
 
 
224 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  58.29 
 
 
221 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  55.92 
 
 
225 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  55.45 
 
 
228 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  57.35 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  56.6 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  56.81 
 
 
226 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  54.55 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  53.85 
 
 
210 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  57.89 
 
 
217 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  48.79 
 
 
243 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  48.34 
 
 
231 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  53.37 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  50.7 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  52.15 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  50.46 
 
 
218 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  49.06 
 
 
216 aa  207  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  49.76 
 
 
220 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  50 
 
 
220 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  52.55 
 
 
226 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  52.5 
 
 
208 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  48.53 
 
 
215 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  52.5 
 
 
208 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  47.32 
 
 
210 aa  198  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  49.02 
 
 
210 aa  197  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  49.76 
 
 
212 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  48.04 
 
 
210 aa  194  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  49.02 
 
 
212 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  48.11 
 
 
214 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  47.64 
 
 
214 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  48.28 
 
 
218 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  48.28 
 
 
218 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  47.62 
 
 
212 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  48.79 
 
 
213 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  48.79 
 
 
213 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  48.79 
 
 
213 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  48.31 
 
 
213 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  48.79 
 
 
213 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  48.79 
 
 
213 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  48.79 
 
 
213 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  47.62 
 
 
213 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  46.89 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  46.6 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  48.7 
 
 
204 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  48.06 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  48.06 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  48.06 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  48.06 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  47.85 
 
 
212 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  47.85 
 
 
212 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  47.62 
 
 
212 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  47.57 
 
 
212 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  47.62 
 
 
212 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  47.62 
 
 
212 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  46.89 
 
 
213 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  51.71 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  43.84 
 
 
222 aa  167  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  42.34 
 
 
224 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  39.07 
 
 
216 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  42.57 
 
 
220 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  39.37 
 
 
224 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.22 
 
 
215 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.75 
 
 
214 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  30.33 
 
 
215 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 
264 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  34.92 
 
 
213 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 
215 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  32.7 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  34.76 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  30.39 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  31.91 
 
 
219 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  31.41 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  33.82 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  30.95 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  30.95 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.21 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  30.89 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  32.78 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  30.7 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  30.48 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  33.68 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  29.61 
 
 
227 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>