More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3382 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  59 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  60.91 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  58.88 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  60.1 
 
 		 220 aa  225  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  58.88 
 
 		 222 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  58.38 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  59.9 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  60.2 
 
 		 220 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  60.1 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  55.5 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  60.62 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  55.67 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  57.89 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  57.28 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  55.78 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  49.02 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  49.02 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  55.5 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  48.78 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  54.55 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  54.55 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  54.97 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  50.26 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  45.37 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  54 
 
 		 204 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  48.44 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  44.34 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  46.67 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  46.67 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  46.67 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  46.67 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  46.19 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  45.71 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  44.88 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  48 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  48 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  45.83 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  46.35 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  45.93 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  47.32 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  45.83 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  50 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  46.46 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  46.83 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  46.11 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  47.89 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  45.5 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  47.15 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  47.15 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  47.15 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  46.84 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  46.32 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  46.32 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  46.32 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  46.32 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  46.32 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  46.32 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  45.45 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  45.08 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  44.92 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  43.44 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  45.5 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  45.05 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  45 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  42.21 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  29.26 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  34.41 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  35.79 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  37.43 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.11 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  30.22 
 
 		 180 aa  95.5  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  31.22 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.21 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  30.99 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.62 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  36.07 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  34.09 
 
 		 398 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  28.91 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  32.21 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  30.41 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.56 
 
 		 265 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.8 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  38.73 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  32.43 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  35.15 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  34.55 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  35.08 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  36.42 
 
 		 332 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  34.55 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  34.55 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>